Цаг уур орчны шинжилгээний хэлтсийн үндсэн чиг үүрэг: 

Ус, Цаг уурын шинжилгээний улсын сүлжээний нэгжүүдийг зохион байгуулах, хөтөлбөрийн хэрэгжилт, хэмжлийн нэгдмэл байдал, сүлжээний тасралтгүй хэвийн ажиллагааг хангах, техник технологийн шинэчлэлийг нэвтрүүлж, салбар нэгжүүдээ технологи арга зүй нэгдсэн удирдлагаар хангах,  ус, цаг уур, орчны хяналт шинжилгээний ажил гүйцэтгэх, мэдээлэл цуглуулах, боловсруулах, дүн шинжилгээ хийх, иргэн, аж ахуйн нэгж, байгууллагыг ус цаг уур, орчны мэдээллээр хангах үүрэг бүхий байнгын тасралтгүй ажиллагаатай салбар, нэгжүүд ажиллана.